Что такое энхансер?
Определение понятия Enhancer:
Энхансер — это короткий фрагмент или последовательность ДНК, которая работает для усиления или ускорения скорости генетической транскрипции. Энхансер также часто называют цис-регуляторным элементом, его размер составляет от 20 до 400 пар оснований ДНК.
Расположение:
Инхансер может быть расположен как выше, так и ниже по течению от определенного гена и может иметь ту же или другую ориентацию по сравнению с транскрибируемым геном. Для функционирования энхансер не обязательно должен находиться рядом с сайтом инициации транскрипции. Энхансеры присутствуют и функционируют как в прокариотических, так и в эукариотических клетках. Энхансеры могут находиться в интронах и экзонах и действовать на гены другой хромосомы.
Функция:
Фактор транскрипции присоединяется к энхансеру, чтобы помочь стимулировать транскрипцию гена. Энхансеры, по сути, не действуют непосредственно на промоторы, а сначала должны быть присоединены к транскрипционным факторам. Энхансеры могут находиться на расстоянии тысяч оснований от сайта инициации транскрипции. Это возможно благодаря тому, как функционируют энхансеры. Сначала транскрипционные факторы связываются с энхансером. Затем белок, сгибающий ДНК, приближает энхансер к промотору в процессе, известном как «петля ДНК». Таким образом, энхансеры усиливают или ускоряют скорость транскрипции, приближая транскрипционные агенты к промотору. Энхансеры также могут регулировать более одного гена, независимо от их ориентации относительно генов или генов. Энхансеры также являются важным генетическим элементом в развитии, поскольку они могут способствовать усилению активации транскрипции в клетках.
Важность:
Некоторые энхансеры могут играть определенную роль в заболеваниях человека, и исследования показывают, что цис-регуляторы действительно могут повышать риск таких заболеваний, как диабет 2 типа, сердечно-сосудистые заболевания и колоректальный рак.
Примеры энхансеров:
Примером обнаруженного генного энхансера является HACNS1, который, как полагают, сыграл роль в эволюции большого пальца человека. Другим примером энхансера является проксимальный энхансер эпибласта (PEE), который является важным энхансером во время развития тела позвоночных.
Что такое промоутер?
Определение понятия «Промоутер»:
Промоторы — это фрагменты последовательностей ДНК, которые указывают место начала транскрипции ДНК РНК-полимеразой. Промоторы участвуют в инициации или начале генетической транскрипции, поскольку они определяют, какая нить ДНК будет транскрибироваться (т.е. какая нить является смысловой), и в каком направлении будет происходить транскрипция.
Расположение:
Промоторы обычно находятся выше по течению от начала транскрипции на 5’конце того места, где начинается транскрипция. Промоторы должны находиться в 5’положении рядом с транскрибируемым геном. 5’конец ДНК относится к нити ДНК, которая заканчивается на 5’углероде. Промоторы встречаются как в прокариотических, так и в эукариотических клетках.
Функция:
Промоторы связываются как с ферментом РНК-полимеразой, так и с факторами транскрипции. Промотор инициирует процесс транскрипции, взаимодействуя с РНК-полимеразой и факторами транскрипции. Фермент РНК-полимераза слабо связывается с последовательностью ДНК и движется вдоль нити, пока не встретит промотор. На этом этапе он образует закрытый комплекс с промотором. Затем РНК-полимераза начинает разматывать ДНК в месте инициации транскрипции или старта, образуя открытый промоторный комплекс. После этого начинается транскрипция.
Важность:
Определенные генетические промоторы могут быть вовлечены в заболевания. Изменения в промоторах могут быть связаны с определенными заболеваниями, такими как бета-талассемия и астма.
Примеры промоутера:
Многие эукариотические клетки имеют важную часть промотора, известную как TATA-бокс, который может быть найден от 25 до 35 оснований вверх по течению от начальной точки транскрипции. Было обнаружено несколько примеров промоторов. Некоторые из них важны для развития рака. Например, промотор PEG-3 и обратной транскриптазы теломеразы человека (hTERT), которые встречаются в раковых клетках.
Разница между энхансером и промотором?
Определение
Усилитель — это участок ДНК, который усиливает транскрипцию гена. Промотор — это участок ДНК, который инициирует или запускает транскрипцию гена.
Связывается с
Энхансер связывается с факторами транскрипции, а промотор связывается с факторами транскрипции и ферментом РНК-полимеразой.
Расположение
Энхансер может находиться выше или ниже по течению от места начала транскрипции, в то время как промотор всегда находится выше по течению от места начала транскрипции.
Расстояние
Энхансер не обязательно должен находиться близко к месту начала транскрипции, в то время как промотор должен находиться близко к месту начала транскрипции.
Функция
Энхансер работает для усиления или увеличения транскрипции, в то время как промотор работает для инициации процесса транскрипции.
Важность
Считается, что энхансеры связаны с такими заболеваниями, как диабет 2 типа, сердечно-сосудистые заболевания и колоректальный рак. Считается, что промоторы связаны с такими заболеваниями, как астма и бета-талассемия.
Примеры
Примеры энхансеров включают HACNS1 и PEE. Примерами промоторов являются промотор PEG-3 и обратная транскриптаза теломеразы человека (hTERT).